Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF6O75683 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF6O75683 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF6O75683 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SURF6O75683 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SURF6O75683 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SURF6O75683 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SURF6O75683 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SURF6O75683 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SURF6O75683 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SURF6O75683 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SURF6O75683 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms