Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms