Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms