Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms