Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms