Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms