Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms