Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms