Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms