Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms