Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms