Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP4Q9BWG4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms