Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FYCO1Q9BQS8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms