Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms