Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms