Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC38A2Q96QD8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms