Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms