Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms