Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms