Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOPBP1Q92547 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms