Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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