Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMTC2Q8N394 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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