Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMC1Q7Z7K0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms