Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms