Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXF1

TMEM108, Transmembrane protein 108, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM108Q6UXF1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM108Q6UXF1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM108Q6UXF1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM108Q6UXF1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM108Q6UXF1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM108Q6UXF1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM108Q6UXF1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM108Q6UXF1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM108Q6UXF1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TMEM108Q6UXF1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TMEM108Q6UXF1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM108Q6UXF1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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