Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZN7

HCP5, HLA class I histocompatibility antigen protein P5, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCP5Q6MZN7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HCP5Q6MZN7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms