Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms