Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC158Q5M9N0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms