Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms