Protein–RNA interactions for Protein: Q53HV7

SMUG1, Single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMUG1Q53HV7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMUG1Q53HV7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms