Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
TSNAXIP1Q2TAA8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNAXIP1Q2TAA8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms