Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms