Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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