Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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