Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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