Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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