Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
STRN3Q13033 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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