Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms