Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDSPL2Q05D32 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms