Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms