Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GEMP55040 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GEMP55040 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GEMP55040 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GEMP55040 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GEMP55040 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEMP55040 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEMP55040 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEMP55040 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms