Protein–RNA interactions for Protein: P49703

ARL4D, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4DP49703 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL4DP49703 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms