Protein–RNA interactions for Protein: P43657

LPAR6, Lysophosphatidic acid receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR6P43657 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR6P43657 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms