Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP6P35125 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP6P35125 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP6P35125 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP6P35125 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP6P35125 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP6P35125 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP6P35125 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP6P35125 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP6P35125 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP6P35125 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP6P35125 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP6P35125 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
USP6P35125 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP6P35125 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP6P35125 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP6P35125 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP6P35125 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP6P35125 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP6P35125 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP6P35125 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP6P35125 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP6P35125 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP6P35125 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP6P35125 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP6P35125 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP6P35125 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP6P35125 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP6P35125 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms