Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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CASQ1P31415 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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CASQ1P31415 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CASQ1P31415 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CASQ1P31415 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CASQ1P31415 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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