Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCP25054 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCP25054 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCP25054 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCP25054 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCP25054 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCP25054 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCP25054 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCP25054 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCP25054 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCP25054 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCP25054 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCP25054 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APCP25054 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCP25054 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCP25054 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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