Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms