Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL2P19875 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL2P19875 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms