Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM21P19474 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms