Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX3O75364 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX3O75364 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX3O75364 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX3O75364 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX3O75364 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms